Фамилия Мавродин, а также родственные фамилии Мавроди и Мавродиев произошли от старинного древнегреческого имени Мавродий. Имя означает «песнь мавра» (Мавр и «ode») либо — лишать блеска, затемнять. Возможно, родоначальник носил имя Мавродий, его дети и внуки стали в последствии Мавродины.
В исторических хрониках отмечено болгарское селение Мавродинъ (1769—74 г). Жители и переселенцы населенных пунктов могли быть Мавродины.
Известным носителем данной фамилии является Владимир Васильевич Мавродин (1908 — 1987 г), советский историк, профессор ЛГУ (исторического факультета), специалист по этнической истории русского народа и древнерусской государственности.